除疫情封路影响到的原奶运输外，据记者了解，现在奶牛养殖业的养殖成本高，与国外奶价无法竞争，原奶价格不稳定等因素，仍是国内上游养殖业发展的主要困难。
饲料成本占总成本73.9%
据拥有500头奶牛养殖规模的绿康奶业张长明介绍，前期想建设700头奶牛养殖规模的奶牛场，最少需要投入700万元，这还是不算买牛的钱。据了解，这笔钱主要用于牛棚、奶厅、青贮池、机械、道路等等。
关于目前奶牛的售价，张长明说道，目前一头牛市场价在2万元左右，他这样的牧场想要回本，没有意外的话也需要10年时间。
据悉，自2008年“三聚氰胺”事件起，上游养殖业就曾经历过许多的“意外”，而也正是这些“意外”，导致国内不少奶农退出了养殖圈，剩下的奶农，也在苦苦坚持，直至近年奶价上涨才有所好转。
河北君乐宝乳业集团总裁魏立华公布的数据显示，截至2018年7月，国内奶牛养殖户总数只有3.56万户，较2011年的数据大降九成。
首先是饲料成本上，张长明表示，近年饲料虽然涨价幅度不多，但随着自养奶牛数量的增多，算起来也是一笔不小的支出。目前每头牛的饲料成本是55元，吃的都是饲料厂的精料，售价3000元/吨，如果吃其他的饲料，则会影响到产奶量。
据悉，现代牧业在其2018年年报中也提到，受中美贸易拉锯升级，美国对华特定货物加收25%关税，其中就包括苜蓿和大豆，加上国内玉米供给侧改革，玉米可种植地缩少使玉米价格上涨，两者对国内养殖业成本带来压力。
据其2018年年报显示，现代牧业销售收入49.57亿元；原奶销售成本为33.12亿元；其中饲料成本为24.49亿元，占比73.9%。
疫苗、人工等其他费用
其次，奶牛的发病率虽然不高，但疫苗接种也是必不可少的，据了解，奶牛的主要疫病风险包括口蹄疫、结核病、布鲁氏菌病、乳房炎等，而奶牛的疫苗主要包括口蹄疫疫苗(A型苗和亚洲O型苗)、牛流行热疫苗、炭疽疫苗、牛布鲁氏杆菌疫苗等。如果奶牛生病的话，很容易对产奶量和奶质产生影响。
除了奶牛的养殖成本外，人工成本也是养殖业不可忽视的成本。奶牛养殖需要专业的技术培养和专业人员管理。以张长明介绍的牧场为例，奶厅厅长的工资比普工要高一倍，配种员的工资还要更高。
另外，环保支出也是一项很大的费用，据了解，华夏畜牧兴化有限公司的一位前员工曾介绍，除占比最大的饲料费用外，污水处理费用也是开销大头。在其牧场中，每吨废水的处理费用是31元至32元，牧场每天大概会产生600吨废水，每天一个牧场的废水处理费需近2万元。
还有，奶牛养殖基地的土地使用费，有的奶农是用租金的形式支付，有的奶农是采用一次性支付的方式，而根据《中国奶牛养殖业成长的烦恼成也土地败也土地》论文的表述，土地是发展奶牛养殖业必须投入的不可或缺的生产要素，如果没有足够的土地支撑，发展奶牛养殖业就会面临着优质精粗饲料供给不足和环境承载超负荷的双重挑战。
这也意味着，发展奶牛养殖业需要利用大范围的土地面积。那么，奶农在发展牧场的时候，就需要进一步的进行土地扩建，这其中就涉及土地使用成本的问题。
新希望集团董事长刘永好在其《关于支持奶业振兴，扶持奶牛规模化养殖基地建设的提案》中也曾建议，应当增强对种养结合与规模化饲养奶牛的土地资源支持和资金支持。这其中包括应鼓励利用非基本农田、一般经济林地等建设规模化、种草养牛循环的生态牧场；在牧场周边配套适当面积的土地；对于环保达标的养殖公司、家庭牧场推行排污费减免政策等等。
原奶价格受干扰因素多
此外，作为上游养殖业，最担心的除了养殖成本外，还有收益问题。前几年，原奶价格曾一度处于低迷状态。
在不少上市牧业公司的年报中，都曾有表示因原料奶售价下降而导致营业收入与利润受影响。
在过去奶业低谷时期，再加上成本的压力，很多牧场处于亏损状态，相当一部分中小牧场退出。不过近年，奶价的回涨，使不少牧场得以好转。
另外，在产销量方面，不少牧场有产能过剩的情况。以现代牧业为例，据其2018年年报显示，全年原奶总产量达127.9万吨，原奶总销量为125.1万吨。
为此，相关上市公司为了解决生鲜乳过剩的问题，均有发展其下游产业。而一些中小牧场为了解决生鲜乳生产过剩的问题，则是通过自有牧场奶吧的形式销售。以山东为例，2017年11月底的统计数据显示，山东省共有1750家奶吧，这些奶吧绝大部分都有自己的牧场。山东奶协会长张志民曾表示：“如果不是有奶吧，这几年这么折腾，得有多少奶农退出”。
此外，国内外市场联动后，进口原料奶对国内原奶行业的打击也不小。在2014年到2017年间，国际大包粉价格下跌，国内奶牛养殖企业就曾面临过生鲜乳被拒收的问题。
从相关上市公司的亏损一定程度上也可反应行业整体态势。现代牧业自2016年以来累计亏损超过20亿元，中国圣牧连续两年亏损，西部牧业2016、2017年间亏损额度持续扩大。
据公开资料显示，2022年1-11日，我国共计进口各类乳制品271.42吨，同比增加12.6%。因为受原奶价格的问题，国内原奶成本相比国外要高，所以致使不少国内企业更倾向于进口。
而且，目前国内进口乳品数量还有明显的增长趋势。海关总署出口食品安全局巡视员唐光江表示，为满足国内日益增长消费需要，海关总署积极与相关国家开展合作，不断扩大进口乳品来源。2018年以来先后与以色列、俄罗斯、越南、吉尔吉斯、塞尔维亚等国签订了议定书，截至目前获得我国进口乳品准入资格的国家和地区已经达到50个，境外企业已达2627家，乳品生产企业103家。