亚马逊有数据吗 AWS 教您手把手玩转 Apache Superset 可视化 Amazon S
AWS 教您手把手玩转 Apache 可视化 Amazon S3 里的数据byAWS Team | on16 5月 2020 | inAWS Big Data | |
为了让数据挖掘和数据查询能够更加普世化，惠及更多的想使用数据的但缺乏SQL能力的一般数据消费者，各类数据可视化工具应运而生，像Amazon 就是这样一款产品。目前AWS中国区Amazon 还没有上线，开源界也有不少好用的可视化项目，Apache 就是其中之一。
本篇博客会带您一步一步地在AWS上部署Apache 并在上创建一个展示新冠肺炎情况的（示例如下）。新冠肺炎数据存储于Amazon S3上并通过Amazon Athena来直接查询。
Apache 基本功能：
准备好我们就开始吧，以下步骤基于AWS 宁夏区域！
步骤 1：使用docker部署apache
本步骤阐述了如何在Amazon Linux环境中部署，并且在宁夏区域已经准备好了一个公用的 AMI环境。这个AMI中包含了所有下述步骤创建的报表和所需数据，如果直接使用此AMI的话可以跳过步骤1，AMI 名字 为AWS-Demo--Covid19，可以在宁夏区Amazon EC2 公有映像中找到。登录的用户名密码默认都是admin，默认的Web端口是8088。
注意：此AMI仅供本博客教学演示使用，非官方认证AMI请勿直接用于生产环境。
1.1 启动一台Amazon Linux EC2并安装启动docker环境，需要机型为t.xlarge及以上，EBS盘20GB以上。
sudo yum update -y
# install python3 gcc
sudo yum install -y python3 libpq-dev python3-dev
sudo yum install -y gcc gcc-c++
# add following into ~/.bashrc
echo "export PATH=/usr/local/bin:$PATH" >> ~/.bashrc
echo "alias python=python3" >> ~/.bashrc
echo "alias pip=pip3" >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
python --version
# install docker
sudo yum -y install docker
sudo usermod -a -G docker ec2-user
sudo systemctl start docker
sudo systemctl status docker
sudo systemctl enable docker
sudo chmod 666 /var/run/docker.sock
docker ps
# install docker-compose
sudo curl -L "https://github.com/docker/compose/releases/download/1.25.4/docker-compose-$(uname -s)-$(uname -m)" -o /usr/local/bin/docker-compose
sudo chmod +x /usr/local/bin/docker-compose
sudo ln -s /usr/local/bin/docker-compose /usr/bin/docker-compose
docker-compose --version
1.2 下载 Docker文件
sudo yum install -y git curl
git clone https://github.com/apache/incubator-superset/1.3 修改安装插件以支持Athena数据源
cd incubator-superset
vi Dockerfile
加入连接Athena需要的依赖
RUN pip install PyAthenaJDBC \
&& pip install PyAthena \
&& pip install psycopg2
重新build和启动
docker-compose build
docker-compose up
需要配置管理员用户权限，在docker/docker-init.sh中默认创建用户admin（密码也是admin）但权限并没有更新，通过以下命令更新权限
docker-compose exec superset bash
superset init
1.4 配置成功后亚马逊有数据吗，默认使用8088端口，使用:8088访问，用户名和密码均为admin（注意：国内AWS账户需要ICP备案才能访问）
1.5 本实验使用本地存储来保存用户名和密码亚马逊有数据吗，如需要配置外部的数据库用来存储登录数据Docker的配置请参考Github文档 。另外也支持LDAP或者OpenID登录，配置文件
步骤 2：配置新冠数据实时数据源
本实验中的数据来源于约翰.霍普金斯大学的实时更新的开放数据集。此S3存储桶在海外账户，如果海外账号可以参照博客，但如果国内区域的话需要同步到国内的S3桶中使用。
2.1 同步海外S3的数据源到宁夏S3
Option 1:可以使用同步工具设置源桶和目标桶来同步数据
需要同步的S3路径为s3://covid19-lake/enigma-jhu/，每个文件夹里面有json和csv两种类型的数据，选择其一即可。此数据缺乏省市名字到ISO3166-2代码映射表，中的城市地图需要用到。需要使用AMI （AWS-Demo--Covid19）中的g数据。
Option 2: 2020-04-22号的静态数据存储在机器AMI（AWS-Demo--Covid19）的/home/ec2-user/data/ 可使用以下命令上传到位于宁夏的S3桶中
aws s3 cp /home/ec2-user/data/ s3://<宁夏S3桶名字>/ --recursive2.2 AWS Glue爬取S3数据生成Athena 表
配置一个Glue的爬网程序，指定宁夏S3桶数据的根目录（包含两张表的数据，爬虫会自动分表），并配置表前缀为 数据库为covid19。具体操作参照官方文档。
2.3 原始数据存在一些重复值和需要丰富的部分，可以使用Amazon Athena创建view来简单处理。如果想要把处理的结果持久化还是推荐使用AWS Glue来做定时的ETL。创建语句如下：
CREATE OR REPLACE VIEW "daily_region_stats" AS
SELECT date_trunc('day', CAST(date_parse(last_update, '%Y-%m-%dT%T') AS TIMESTAMP)) AS day,
combined_key as region,province_state,country_region, max(/confirm/ied) as confirmed ,max(deaths) as deaths,max(recovered) as recovered
FROM "covid19"."covid19_enigma_jhu"
group by date_trunc('day', CAST(date_parse(last_update, '%Y-%m-%dT%T') AS TIMESTAMP)),
combined_key,province_state,country_region
CREATE OR REPLACE VIEW region_stats_snapshot AS
WITH
src AS (
SELECT
"province_state"
, "combined_key"
, (CASE "country_region" WHEN 'US' THEN 'United States' ELSE "country_region" END) "country_region"
, "max"("/confirm/ied") "/confirm/ied"
, "max"("deaths") "deaths"
, "max"("recovered") "recovered"
FROM
covid19.covid19_enigma_jhu
GROUP BY "province_state", "country_region", "combined_key"
)
SELECT
src.*
, "iso_code"
FROM
(src
LEFT JOIN covid19_province_code_mapping USING (province_state))
步骤 3：配置ATHENA数据源并创建
如果使用AMI（AWS-Demo--Covid19），图表和已经配好，只需要修改步骤3.1中数据库连接中的为自己的S3地址即可，另外EC2的IAM角色需要有相应权限。以下步骤仅展示的基本功能，如果想要深入了解细节操作请参照官网。
3.1 中可以指定不同的数据源，通过 Sources-> 添加Athena为数据源。
部署的EC2附加的IAM角色需要有 Athena查询和Glue Catalog的权限，为方便起见可以赋予和。但实际情况请按照最小权限原则来保障安全。
Athena连接URL：
+rest://@/default?=
3.2 要使用表前需要先在中定义表及聚合指标，通过Sources->Tables添加新表（绿色+图标），并设置好需要的聚合指标（Metrics）
修改表中Metrics，Verbose Name是想要显示的指标名字，范例可参照AMI中已有的表格
3.3 Charts是中的做图功能，可以绘制单一图表并有不同的图表选择。通过选择选择不同的聚合方式生成图表。在表列中点击表名字即可进入如下做图编辑页面。
点击Run Query后会应用所选的值形成SQL查询，并且生成的SQL查询语句和相应的返回结果都可以在线查看
3.4 保存相应的Charts时候可以选择把Charts加入。如果使用AMI部署，中可以找到已建好的文首所述的新冠肺炎情况看版。
3.5 除了使用Charts的方式编辑查询数据，还为熟悉SQL的用户准备了SQL Lab功能。和Athena类似发发库Sitemaps，此处可以直接查询数据源中的数据。
总结
除了Athena数据源，还支持各种各样的JDBC连接数据库甚至Apache Druid，支持的数据源种类详见官网。现在我们完成了一个简单的新冠肺炎情况看版亚马逊有数据吗 AWS 教您手把手玩转 Apache Superset 可视化 Amazon S，此看版还可以添加更多的指标和展示方式比如添加每日新增的趋势，top死亡率列表等等。更多的功能和完善方式等着你来探索！
本篇作者
贺浏璐
AWS解决方案架构师，负责AWS云计算方案的咨询和架构设计，同时致力于大数据方面的研究和应用。
梁睿
AWS解决方案架构师，主要负责企业级客户的上云工作，服务客户涵盖从汽车，传统生产制造，金融，酒店，航空，旅游等，擅长DevOps领域。11 年 IT 专业服务经验114信息网sitemaps，历任程序开发，软件架构师、解决方案架构师。
TAGS:Amazon Athena, AWS Glue, data , , 梁睿, 贺浏璐
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